El estadounidense salió lento de los tacos bajo un sol radiante y condiciones secas y no tomó la delantera hasta aproximadamente la mitad de la carrera, para terminar con un tiempo de 9.95 segundos.
Más de dos horas antes, Lyles había corrido 10.05 segundos en su serie.
"Puede que este sea mi tercer o cuarto mejor debut de temporada, así que es una señal muy positiva para el resto del año", declaró el velocista. "He estado entrenando muy bien, así que ha valido la pena el viaje", indicó.
Lyles terminó por delante de su compatriota Tate Taylor (10.04) y del británico Jake Odey-Jordan (10.09).
"No estaba sintiendo buenas sensaciones con la colocación de mi pie trasero, pero a veces simplemente hay que decir: olvídalo, no te preocupes por eso; solo corre la carrera y da lo mejor de ti", explicó.
Noah firmó un magnífico regreso al estadio donde conquistó el oro en los 200 m en el Mundial del año pasado, igualando el récord de Usain Bolt con cuatro títulos en esa distancia.
Además, también ganó el bronce mundial en los 100 m, por detrás de los jamaicanos Oblique Seville y Kishane Thompson.
N. Lyles mostró su habitual energía ante el público de Tokio, posando como en la serie de anime japonesa One Piece antes de la carrera. "Quiero que la gente disfrute viéndome correr", afirmó.
"No quiero que solo me miren y luego no digan nada. Quiero que se diviertan, que se vayan a casa con esa sensación de 'quiero volver a ver eso'", concluyó.
Rai Benjamin domina en los 400 m lisos
El campeón olímpico y mundial de 400 m vallas, Rai Benjamin, se impuso en la prueba masculina de los 400 metros lisos con un tiempo de 44.69 segundos.
El norteamericano compitió por primera vez desde que ganó el título mundial de 400 m vallas en septiembre del año pasado.
Rai calificó su actuación como una "puesta a punto", a pesar de quedarse a menos de medio segundo de su mejor marca personal (44.21).
"Se trataba simplemente de salir aquí, armar una buena carrera y no obsesionarse tanto con hacer un tiempo loco", comentó Benjamin, cuya próxima competición será la Diamond League de Estocolmo el 7 de junio.