Los Saints estaban a punto de disputar su primera final en 23 años cuando Finn Azaz adelantó al conjunto del Championship con un gran gol a once minutos del final.
Sin embargo, el City ha reaccionado de inmediato gracias a Jeremy Doku, antes de que un golazo de Nico González decantara la semifinal 2-1.
El equipo de Guardiola ha perdido las dos últimas finales de la FA Cup ante el Crystal Palace y el Manchester United. En la 2023, venció a los Red Devils.
El City, que se enfrentará a Chelsea o Leeds en la final, sigue en la pelea por lograr el triplete nacional.
El conjunto de Guardiola ha levantado la Copa de la Liga el mes pasado y está inmerso en una dura lucha por el título de la Premier League con el Arsenal.
"Ningún equipo ha llegado a cuatro finales seguidas. Es extraordinario y ojalá podamos llegar con un buen momento," ha afirmado Guardiola.
La decisión del técnico del City de hacer ocho cambios respecto al once que venció 1-0 al Burnley el miércoles parecía equivocada, ya que el Southampton ha dominado la primera parte.
Pero el equipo de Guardiola ha mejorado notablemente tras el descanso y se ha visto beneficiado por la entrada desde el banquillo de Doku, Erling Haaland y Bernardo Silva.
"Ha sido complicado, pero los extremos (Doku y Savinho) cuando han salido han cambiado el ritmo," ha añadido Guardiola.
"La primera vez que cruzaron el mediocampo hicieron un gol fantástico. El fútbol siempre es impredecible, pero la forma en la que hemos jugado en la segunda parte ha sido extraordinaria."