El serbio, de 39 años, tuvo problemas físicos, pero resistió en el desempate del segundo set para sumar su primera victoria en cualquier torneo desde Wimbledon, en julio.
El antiguo número uno del mundo se enfrentará en segunda ronda al invitado Bu Yunchaokete, de China.
Los aficionados llenaron las gradas de Pekín para ver a Djokovic, uno de los grandes favoritos en China, que nunca ha perdido en Pekín en 30 partidos, aunque este era su primer encuentro en el torneo desde 2015.
El serbio deleitó al público con un ace para cerrar el primer juego y salvó dos bolas de break después de cometer dos dobles faltas para llevarse el primer set.
Djokovic ha tenido problemas de salud en los últimos meses y le costó sumar puntos al inicio del segundo set. Entre juegos se estiró la espalda con la raqueta y necesitó una pausa médica mientras un fisioterapeuta trabajaba en su hombro derecho.
Pero se abrió camino hacia la victoria en una hora y 50 minutos. La certificó cuando Borges, número 49 del mundo y representante de Portugal, devolvió la pelota a la red.
Así, Djokovic mantuvo su racha de victorias en Pekín, donde ha conquistado seis títulos.