En esta montañosa 19ª etapa con final en Champoluc, Del Toro y el ecuatoriano Richard Carapaz, segundo de la general, acabaron igualados a 58 segundos del ganador del día.
El joven ciclista mexicano, de 21 años, amplía ligeramente su ventaja al frente de la clasificación respecto a su rival sudamericano gracias a haber arañado unos segundos en las bonificaciones.
De esa forma, el corredor azteca elevó su ventaja respecto a Carapaz de los 41 a los 43 segundos.
El que queda más descolgado respecto a ambos es el británico Simon Yates, tercero de la general y que fue séptimo de la etapa, dentro del grupo que entró a un minuto y 22 segundos de Prodhomme.
Yates ve ampliar su desventaja con la cabeza a 1:21.
Nicolas formó parte de los escapados del principio del día y el corredor del Decathlon-AG2R se distanció en solitario a 28 kilómetros para el final.
En el último puerto del día, a falta de siete kilómetros, Richard lanzó un ataque, pero Isaac le siguió y mantuvo su ritmo.
El francés siguió en cabeza hasta el final, para firmar su segunda victoria de esta temporada, tras una etapa conquistada el pasado mes en el Tour de los Alpes.
"Quería ganar esta etapa. He esperado mucho para conseguir una victoria y ahora he logrado dos en un mes, así que estoy muy feliz", declaró el gran triunfador del día.
La 20ª etapa será la decisiva en la lucha por el título en este Giro. De nuevo con perfil montañoso, incluye en su parte final el temible Colle delle Finestre.
Del Toro, que se vistió con la 'maglia' rosa de líder en la novena etapa en Siena, tratará de resistir allí los ataques de su principal rival, antes de una última etapa el domingo que servirá para coronar al campeón en la llegada a Roma.